Avanzando en la caracterización transcriptómica de bacterias aerotransportadas

La investigación en aerobiología centrada en la dinámica de las partículas de bioaerosoles ha catalogado la identidad, distribución y abundancia de microbios presentes en el aire en una gran variedad de ambientes interiores y, más recientemente, ha explorado métodos de desinfección en interiores para microorganismos de relevancia médica. A pesar de su importancia en la salud ambiental y de nuestra exposición constante a microbios aerotransportados en la vida cotidiana, sorprendentemente se sabe poco sobre la actividad de los bioaerosoles vivos y sus respuestas metabólicas ante el estrés de aerosolización y suspensión. En este contexto, el ARN mensajero microbiano (ARNm) representa una valiosa fuente de información sobre respuestas casi en tiempo real de los organismos, que no puede obtenerse a través de estudios genómicos, proteómicos o metabolómicos.

Esta revisión analiza el conocimiento actual derivado de estudios transcriptómicos que describen la actividad celular de bacterias aerotransportadas en respuesta a una multitud de factores de estrés ambiental que actúan rápidamente durante la aerosolización y su continua suspensión como bioaerosoles microscópicos. En el contexto del perfil transcriptómico, se discuten los posibles artefactos asociados con la aerosolización y recolección de bioaerosoles desde la perspectiva de preservar el ARNm y mantener su fidelidad tal como existe en los microbios aerotransportados.

Se presentan recomendaciones para avanzar en la caracterización metabólica de bioaerosoles vivos mediante estudios de expresión génica, con el fin de mitigar artefactos inherentes y desafíos propios de los experimentos modernos con bioaerosoles. Estas recomendaciones incluyen el uso de cámaras experimentales más grandes, el control de temperatura durante los procesos de aerosolización, y la captura de bioaerosoles en fase líquida dentro de un conservador de ácidos nucleicos para mejorar la fidelidad del ARN recolectado y reflejar mejor la actividad transcripcional de los microorganismos presentes en el aire.

Con el tiempo, las mejoras en la caracterización de la actividad de bioaerosoles podrán contribuir a responder preguntas fundamentales sobre el aerobioma, tales como: ¿es la atmósfera una autopista temporal o un hábitat para los microorganismos?

Kraus EA, Prithiviraj B, Hernandez M. Advancing transcriptomic profiling of airborne bacteria. Appl Environ Microbiol. 2025;91(5):e0014825. doi:10.1128/aem.00148-25

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