Comprendiendo el riesgo de resistencia a los antimicóticos #hongos

Las infecciones fúngicas invasivas, aunque se encuentran con menos frecuencia que las infecciones bacterianas y virales, pueden ser devastadoras, especialmente en pacientes inmunocomprometidos. El aumento de patógenos resistentes a los antifúngicos, como Candida auris y Aspergillus fumigatus, no ha hecho más que aumentar esta preocupación. Pero, ¿qué tan común es la resistencia a los antifúngicos? ¿Quién está en riesgo? ¿Qué patógenos son motivo de especial preocupación y qué importancia tiene la amenaza general?

Understanding the Risk of Antifungal Resistance

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Búsqueda de antibióticos en microbios inusuales y no cultivables

La aparición de patógenos resistentes a los antibióticos ha superado con creces el descubrimiento de nuevos antibióticos para combatirlos. Esto se debe en parte a que los esfuerzos de descubrimiento de antibióticos generalmente se centran en la detección de microbios ambientales cultivables (por ejemplo, bacterias del suelo) en busca de compuestos antimicrobianos. Sin embargo, la mayoría de los microbios ambientales no pueden cultivarse en el laboratorio y, por tanto, son inútiles desde el punto de vista del descubrimiento de fármacos... ¿o no? Con la ayuda de técnicas de cultivo inteligentes, los científicos están logrando acceso a once bacterias inaccesibles y, a partir de estos microbios, descubriendo una avalancha de nuevos antibióticos.

Hunting for Antibiotics in Unusual and Unculturable Microbes

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Origen de la vida: Dibujando el panorama general

Tratando de proporcionar una visión amplia sobre el origen de la vida en la Tierra, se enumeran y discuten las transiciones más significativas de la vida antes de las células. El enfoque actual enfatiza las relaciones simbióticas que surgieron con la vida. Proponemos un escenario racional y gradual para el origen de la vida que comienza con el origen de las primeras biomoléculas y avanza hasta los orígenes de las primeras células. En este camino, nuestro objetivo es proporcionar un modelo teórico breve pero completo que considerará los siguientes pasos: 

• (i) cómo se podrían producir prebióticamente nucleótidos y otras biomoléculas en refugios prebióticos específicos; 
• (ii) cómo se formaron las primeras moléculas de ARN; 
• (iii) cómo se construyó el centro de protopeptidil transferasa mediante la concatenación de proto-ARNt; 
• (iv) cómo podrían estructurarse el ribosoma y el código genético; 
• (v) cómo los progenotes podrían vivir y reproducirse como moléculas de ribonucleoproteína "desnudas"; 
• (vi) cómo los péptidos comenzaron a unir moléculas en la sopa prebiótica permitiendo que evolucionaran vías bioquímicas a partir de esas uniones; 
• (vii) cómo los genomas crecieron por la relación simbiótica de progenotes y la transferencia lateral de material genético;
•  (viii) cómo se ha formado el progenota LUCA ensamblando la mayoría de las rutas bioquímicas; 
• (ix) cómo probablemente surgieron y evolucionaron las primeras cápsides de virión; 
• (x) cómo las membranas de fosfolípidos surgieron probablemente dos veces por la evolución de las proteínas de unión a lípidos; 
• (xi) cómo se ha formado la síntesis de ADN en paralelo en Bacteria y Archaea; y, finalmente, 
• (xii) cómo se han constituido las células basadas en ADN de Bacteria y Archaea. 

El panorama que se ofrece es conjetural y presenta lagunas epistemológicas. Las investigaciones futuras ayudarán a avanzar en el esclarecimiento de las lagunas y la confirmación/refutación de las afirmaciones actuales.

Prosdocimi F, de Farias ST. Origin of life: Drawing the big picture. Prog Biophys Mol Biol. 2023 Jul-Aug;180-181:28-36. doi: 10.1016/j.pbiomolbio.2023.04.005. Epub 2023 Apr 18. PMID: 37080436.

Rosenberg, E.; Zilber-Rosenberg, I. Special Issue: The Role of Microorganisms in the Evolution of Animals and Plants. Microorganisms 2022, 10, 250. https://doi.org/10.3390/microorganisms10020250

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Nota técnica: Instalaciones específicas de investigación con animales libres de patógenos

Las instalaciones de investigación con animales libres de patógenos específicos (SPF, por sus siglas en inglés) brindan espacio de reproducción, alojamiento y procedimientos para animales libres de una lista definida de patógenos. Los animales SPF se diferencian de los animales gnotobióticos, que están completamente libres de gérmenes y requieren instalaciones estériles.

Las instalaciones de SPF deben diseñarse y operarse para proporcionar ambientes libres de patógenos (aunque no estériles) para proteger la salud de los animales y la veracidad de las investigaciones realizadas en ellos. Una instalación SPF puede ser tan pequeña como un microaislador que alberga algunos animales, pero una instalación más típica es una suite dedicada que consta de una o más salas de procedimientos y salas de espera ubicadas dentro de un vivero de uso general más grande. Los animales se crían dentro de las instalaciones del SPF o se introducen después de una cuarentena y pruebas rigurosas para confirmar que están libres de patógenos.

Specific Pathogen-Free Animal Research Facilities. Technical News Bulletin. NIH May 2021; #112.

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El viroma humano sano: de la simbiosis virus-huésped a la enfermedad

Los virus son componentes ubicuos y esenciales de cualquier ecosistema y de los holobiontes de organismos multicelulares. Numerosos virus causan infecciones agudas, matan al huésped o son eliminados por el sistema inmunológico. En muchos otros casos, los virus coexisten con el huésped como simbiontes, ya sea temporalmente o durante toda la vida del huésped. Aparentemente, las relaciones virus-huésped abarcan todo el espectro, desde el parasitismo agresivo hasta el mutualismo. Aquí intentamos delimitar el viroma humano sano, es decir, la totalidad de virus que están presentes en un cuerpo humano sano. La mayor parte del viroma sano consiste en bacteriófagos que infectan bacterias en el intestino y otras ubicaciones. Sin embargo, una variedad de virus, como los anelovirus y los herpesvirus, y los numerosos retrovirus endógenos, persisten replicándose en células humanas, y estos son nuestro enfoque principal. Fundamentalmente, el límite entre los virus simbióticos y patógenos es fluido, de modo que los miembros del viroma sano pueden convertirse en patógenos en condiciones cambiantes.

Koonin EV, Dolja VV, Krupovic M. The healthy human virome: from virus-host symbiosis to disease. Curr Opin Virol. 2021 Apr;47:86-94. doi: 10.1016/j.coviro.2021.02.002. Epub 2021 Feb 27. PMID: 33652230.

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Diplomado: “Gestión de Riesgo Biológico”

Adaptaciones en el diseño del diplomado: “Gestión de Riesgo Biológico” dirigido a estudiantes y profesionales de la salud en Latinoamérica.

Este formulario tiene como objetivo principal realizar adaptaciones en el diseño de un diplomado en "Gestión de Riesgo Biológico" diseñado como proyecto del programa global de mentorías de la IFBA. Para dudas o comentarios adicionales comunicarse con: Michelle Bruno Hernández (michelle.bruno.hz@gmail.com) y/o Luis Alberto Ochoa Carrera (luis@pandemictech.com) 

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Infecciones transmitidas por pacientes al personal de salud

En la Región de las Américas pueden encontrarse varios ejemplos de patógenos emergentes y reemergentes susceptibles de causar brotes comunitarios con casos en los establecimientos de salud. Estos patógenos no solo afectan a la comunidad, sino también al personal de salud en el momento de la atención en salud. La caracterización del riesgo para este grupo implica conocer: 1) la existencia del patógeno, 2) sus reservorios, 3) la cadena de transmisión y 4) las medidas de contención del patógeno para evitar su diseminación en los entornos sanitarios y en la comunidad. 

El objetivo principal del presente documento es caracterizar el riesgo de contagio de un conjunto de enfermedades infecciosas —principalmente las emergentes y reemergentes— para el personal de salud, en una síntesis panorámica que sirva de apoyo para reforzar las conductas de prevención y control de infecciones, sobre todo las precauciones estándar, adaptadas a los mecanismos de transmisión de cada patógeno.

Infecciones transmitidas por pacientes al personal de salud. Síntesis de evidencia

© Organización Panamericana de la Salud, 2023

ISBN: 978-92-75-32548-3 (impreso)

ISBN: 978-92-75-32547-6 (pdf)

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Un atlas a nivel de tejido del viroma humano sano

Antecedentes: Los microbios residentes en humanos pueden influir tanto en la salud como en la enfermedad. La investigación del microbioma utilizando tecnología de secuenciación de próxima generación ha revelado ejemplos de mutualismo y conflicto entre microbios y humanos. En comparación con las bacterias, el componente viral del microbioma (es decir, el "viroma") está poco estudiado. Los tejidos somáticos de individuos sanos suelen ser inaccesibles para el muestreo del viroma; Por lo tanto, existe una comprensión limitada de la presencia y distribución de virus en los tejidos de individuos sanos y de cómo la infección viral se asocia con la expresión genética humana y altera la homeostasis inmunológica.

Resultados: Para caracterizar el viroma humano de una manera específica de tejido, aquí realizamos un análisis metatranscriptómico utilizando el conjunto de datos de secuenciación de ARN del Proyecto Genotype-Tissue Expression (GTEx). Analizamos los 8991 datos de secuenciación de ARN obtenidos de 51 tejidos somáticos de 547 individuos y detectamos con éxito 39 especies virales en al menos un tejido. Luego investigamos las asociaciones entre la infección por virus y la expresión de genes humanos y la aparición de enfermedades en humanos. Detectamos algunas relaciones esperadas; por ejemplo, la infección por el virus de la hepatitis C en el hígado se asoció fuertemente con la regulación positiva de genes estimulados por interferón y con hallazgos patológicos de hepatitis crónica. La presencia del virus del herpes simple tipo 1 en el cerebro de un sujeto está fuertemente asociada con la expresión de genes inmunes. Si bien el virus torque teno se detectó en una amplia gama de tejidos humanos, no se asoció con respuestas al interferón. Destacando su asociación con trastornos linfoproliferativos, la infección por el virus de Epstein-Barr en el bazo y la sangre se asoció con un aumento de células plasmáticas en sujetos sanos. El herpesvirus humano 7 se detectaba con frecuencia en el estómago; Curiosamente, está asociado con la proporción de leucocitos humanos en el estómago, así como con la expresión de genes digestivos. Además, las infecciones virales en los tejidos locales se asocian con respuestas inmunes sistémicas en la sangre circulante.

Conclusiones: Hasta donde sabemos, este estudio es la primera investigación exhaustiva del viroma humano en una variedad de tejidos en individuos sanos mediante análisis metatranscriptómico. Será útil realizar más investigaciones sobre las asociaciones descritas aquí y aplicar este proceso analítico a conjuntos de datos adicionales para revelar el impacto de las infecciones virales en la salud humana.

REFERENCES:
Feng B, Liu B, Cheng M, Dong J, Hu Y, Jin Q, Yang F. An atlas of the blood virome in healthy individuals. Virus Res. 2023 Jan 2;323:199004. doi: 10.1016/j.virusres.2022.199004. Epub 2022 Nov 17. PMID: 36402209; PMCID: PMC10194198.

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Estrategias químicas para laboratorios médicos sostenibles

Los productos químicos son componentes esenciales de nuestra vida diaria, para el bienestar, el alto nivel de vida y el confort de la sociedad moderna. Se utilizan en muchos sectores, incluido el sanitario. Sin embargo, algunas sustancias químicas tienen propiedades peligrosas que pueden dañar el medio ambiente y la salud humana. La contaminación química está contribuyendo significativamente al actual problema global del cambio climático y la pérdida de biodiversidad. Hay un aumento de los problemas de salud que pueden explicarse en parte por el uso de productos químicos. Algunas sustancias químicas creadas por el hombre se encuentran en los lugares más remotos del medio ambiente, pero también en nuestro cuerpo. Los productos químicos están por todas partes. La estrategia en materia de productos químicos para la sostenibilidad hacia un medio ambiente libre de sustancias tóxicas garantizará una mejor protección de la salud humana y el medio ambiente frente a los productos químicos peligrosos, impulsará la innovación en materia de productos químicos seguros y sostenibles y permitirá la transición a productos químicos que sean seguros y sostenibles por diseño. Es un primer paso hacia el objetivo de contaminación cero para un medio ambiente libre de sustancias tóxicas anunciado en el Pacto Verde Europeo. La estrategia propone legislaciones químicas integrales para la transformación de la industria con el objetivo de atraer inversiones hacia productos y métodos de producción seguros y sostenibles. Los laboratorios clínicos deben elegir alternativas más seguras y sostenibles a los productos químicos peligrosos, abordar cuestiones de sostenibilidad e implementar directrices oficiales sobre cómo reducir su huella de carbono.

Ozben T, Fragão-Marques M. Chemical strategies for sustainable medical laboratories. Clin Chem Lab Med. 2022 Dec 22;61(4):642-650. doi: 10.1515/cclm-2022-1157. PMID: 36540037.

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CONVOCATORIA PRÓXIMA A CERRAR

==>  https://amexbio.org/uady/  <==

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Gestión global de equipos de laboratorio y sostenibilidad

Con el tiempo se han realizado importantes inversiones en laboratorios, en particular en equipos sofisticados, para detectar enfermedades emergentes cerca de su origen. Como resultado de ello, la capacidad de diagnóstico se ha ampliado, pero han surgido desafíos. La Encuesta de Sostenibilidad y Gestión de Equipos fue enviada a los Servicios Veterinarios de 182 países a mediados de 2019. Medimos el estado de cuarenta tipos de equipos de laboratorio utilizados en los laboratorios de diagnóstico veterinario. De los 68.455 artículos reportados por 227 laboratorios en 136 países, el 22% (14.894/68.455) tenían mantenimiento inadecuado y el 46% (29.957/65.490) estaban calibrados incorrectamente. Se observaron diferencias notables entre los niveles de ingresos y las regiones del Banco Mundial, lo que generó preocupaciones sobre la confiabilidad de los equipos y los resultados que producen. Nuestros resultados asesorarán a socios y donantes sobre la mejor manera de apoyar a los laboratorios veterinarios de bajos recursos para mejorar la sostenibilidad y cumplir su mandato de prevención y preparación para pandemias, además de alentar a los fabricantes de equipos a estimular la innovación y desarrollar productos más sostenibles que satisfagan las necesidades de los usuarios finales. necesidades.

REFERENCIA:

Lasley JN, Appiah EO, Kojima K, Blacksell SD. Global Veterinary Diagnostic Laboratory Equipment Management and Sustainability and Implications for Pandemic Preparedness Priorities1. Emerg Infect Dis. 2023 Apr;29(4):1-12. doi: 10.3201/eid2904.220778. PMID: 36958021; PMCID: PMC10045690.

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El papel de los laboratorios en la reducción de la huella de carbono

[Fragmento] Los laboratorios de patología tienen una filosofía de mejora de la calidad utilizando herramientas como auditorías, no conformidades y revisiones de la dirección. Un sistema de gestión de calidad eficaz impulsa la reducción de riesgos en los procesos de laboratorio. Aprovechar este mismo sistema puede mejorar el riesgo ambiental de un laboratorio. La función fundamental de desarrollar un plan para reducir los desechos ambientales debe implicar una evaluación del riesgo, una política respaldada por la administración (y el personal), un plan de actividades respaldado por resultados mensurables, procesos de auditoría y no conformidad, y supervisión y rendición de cuentas por parte de la administración. La norma ambiental de la Organización Internacional de Normalización proporciona cierta estructura, un punto de comparación y un proceso de revisión externa. Nada impulsa la mejora como la auditoría externa para comparar lo que dijo que haría con lo que ha logrado.

The Role of Laboratories in Reducing the Carbon Footprint: Waste: Reduce It Before It Reduces You 

 American Journal of Clinical Pathology, Volume 158, Issue 3, September 2022, Pages 322–324, https://doi.org/10.1093/ajcp/aqac056

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Detección sistemática de agentes infecciosos en las aguas residuales

La vigilancia de aguas residuales (WWS), la detección sistemática de agentes infecciosos en las aguas residuales, proporcionó una herramienta valiosa para monitorear la circulación del SARS-CoV-2 durante la pandemia de COVID-19; La vigilancia se ha ampliado de 20 a 53 jurisdicciones en todo Estados Unidos, con una capacidad cada vez mayor para realizar pruebas de detección de más patógenos respiratorios (1,2). Este informe destaca el uso de datos sobre aguas residuales por parte de los cuatro Centros de Excelencia del Sistema Nacional de Vigilancia de Aguas Residuales (NWSS) (California; Colorado; Houston, Texas; y Wisconsin) para guiar las acciones de salud pública durante la temporada de enfermedades respiratorias 2022-23. Esta actividad fue revisada por los CDC, no se consideró investigación y se llevó a cabo de conformidad con la ley federal aplicable y la política de los CDC.*

REFERENCIA
Valencia D, Yu AT, Wheeler A, et al. Notes from the Field: The National Wastewater Surveillance System’s Centers of Excellence Contributions to Public Health Action During the Respiratory Virus Season — Four U.S. Jurisdictions, 2022–23. MMWR Morb Mortal Wkly Rep 2023;72:1309–1312. DOI: http://dx.doi.org/10.15585/mmwr.mm7248a4

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