Hay algunas diferencias entre un área de contención y un área limpia, pero a veces necesitamos las dos cosas. Un área limpia se utiliza mucho en las áreas de producción de microchips, preparación de medicamentos, e incluso en áreas de cirugía. Generalmente se utilizan sistemas de flujo de aire vertical y presión positiva. Un área de contención, es aquella instalación donde la finalidad es mantener a los microorganismos dentro de las áreas de trabajo y evitar que se diseminen al ambiente, y como ejemplos están los laboratorios donde se manejan cultivos de tuberculosis. Pero a veces, se requiere de ambas condiciones, un área estéril y un área de contención. Estas la guía del CDC pueden ser de utilidad para el diseño de instalaciones que requieren de éstas dos condiciones. No necesariamente se requiere de dos instalaciones, pero sí de un sistema que controle la salida de microorganismos. Un sistema de doble o triple puerta puede proveer de las mismas características. La guía de la WHO hablan de los procesos que se requieren para mantener áreas de cirugía limpias, y en un ambiente de bioseguridad.
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