Emerging respiratory viruses, including nCoV: methods for detection, prevention, response and control #WHO

Course information

Overview: This course provides a general introduction to emerging respiratory viruses, including novel coronaviruses. By the end of this course, you should be able to describe:

• The nature of emerging respiratory viruses, how to detect and assess an outbreak, strategies for preventing and controlling outbreaks due to novel respiratory viruses;
• What strategies should be used to communicate risk and engage communities to detect, prevent and respond to the emergence of a novel respiratory virus.

There are resources attached to each module to help you dive further into this topic.

Learning objective: Understand the fundamental principles of emerging respiratory viruses and how to effectively respond to an outbreak.

Course duration: Approximately 1 hour.

Certificates: No certificate available at this time.

There will be more modules published shortly.

Course contents

• Module A: Introduction to Emerging respiratory viruses, including nCoV:

  Overall learning objective: To be able to explain why an emerging respiratory virus, including nCoV are a global threat to human health

• Module B: Detecting Emerging respiratory viruses, including nCoV: Surveillance and Laboratory investigation:

  Overall learning objective: To describe how to detect and assess an emerging respiratory virus outbreak

https://openwho.org/courses/introduction-to-ncov

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#CORONAVIRUS TIMELINE

Fecha	Eventos
2020-ene.-27	2,761 casos confirmados en China, 80 muertos. Camboya informa el primer caso nuevo de coronavirus. El primer caso de coronavirus en Camboya se informó el lunes. El ministro de salud del país anunció en una conferencia de prensa que se detectó el primer caso de coronavirus en un turista chino de Wuhan, el epicentro del brote. Suministros médicos en la exitosa carrera de Wuhan contra el tiempo. El presidente chino, Xi Jinping, el lunes ha dado importantes instrucciones sobre el trabajo de combatir y controlar el nuevo brote de coronavirus, prometiendo confiar en que las personas ganarán resueltamente la pelea. Dos pacientes con coronavirus fueron dados de alta de un hospital de Shanghai después de recuperarse completamente del virus el lunes, según las autoridades locales. Se confirmaron cuatro nuevos casos nuevos de coronavirus entre las 21:00 del 26 de enero y las 9:00 del día siguiente en Beijing, lo que eleva el número de casos confirmados a 72 en la ciudad. Australia confirma el quinto caso de nuevo coronavirus. La Comisión Nacional de Salud de China está celebrando una conferencia de prensa sobre la prevención y el control del nuevo brote de coronavirus el lunes. NDRC asigna 300 millones de yuanes para ayudar a la respuesta al brote de coronavirus de Wuhan. Wuhan suspende los servicios de entrada y salida para ciudadanos chinos. El jefe de la OMS que visita Beijing para discutir el brote de coronavirus. 371 nuevos casos de nuevos coronavirus confirmados en Hubei.

Actualizaciones en: https://seguridadbiologica.blogspot.com/p/coronavirus-time-line.html

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#Coronavirus: estructura genómica, replicación y patogénesis.

La reciente aparición de un nuevo coronavirus (2019 ‐ nCoV), que causó un brote de neumonía viral inusual en decenas de personas en Wuhan, una ciudad central de China, reafirmó el riesgo de los coronavirus planteados para la salud pública. En esta mini revisión, ofrecemos una breve introducción de las características generales de los coronavirus y describimos varias enfermedades causadas por diferentes coronavirus en humanos y animales. Esta revisión ayudará a comprender la biología y el riesgo potencial de los coronavirus que existen en la riqueza de la vida silvestre, como los murciélagos.
REFERENCIA:
Chen Y, Liu Q, Guo D. Coronaviruses: genome structure, replication, and pathogenesis [published online ahead of print, 2020 Jan 22]. J Med Virol. 2020;10.1002/jmv.25681. doi:10.1002/jmv.25681

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Evaluación de riesgo: Epidemia del nuevo coronavirus, Wuhan, China

Se ha aislado un nuevo coronavirus (2019-nCoV) y se ha considerado el agente causante del grupo de 448 casos de neumonía en el área de Wuhan, provincia de Hubei en China, así como de los cuatro casos relacionados con viajes en Tailandia, Japón y el sur Corea.
El 31 de diciembre de 2019, la Comisión Municipal de Salud de Wuhan en la ciudad de Wuhan, provincia de Hubei, China, informó un grupo de casos de neumonía de etiología desconocida, con un enlace común al Mercado Mayorista de Mariscos Huanan de Wuhan (un mercado mayorista de pescado y animales vivos que vende diferentes animales especies).
El 9 de enero de 2020, China CDC informó que se había detectado un nuevo coronavirus (2019-nCoV) como agente causal y la secuencia del genoma se puso a disposición del público. El análisis de secuencia mostró que el virus recientemente identificado está relacionado con el clado SARS-CoV. Los sistemas de detección se han desarrollado y están disponibles para los Estados miembros a través de la OMS y el catálogo global del European Virus Archive.
Hasta el 20 de enero de 2020, se ha informado de un total de 295 casos confirmados por laboratorio infectados con 2019-nCoV, 291 de Wuhan, China y cuatro asociados de viaje de Tailandia (2), Japón (1) y Corea del Sur (1). Se han reportado cuatro muertes entre los casos. Las autoridades sanitarias chinas han confirmado la transmisión de persona a persona y se informa que 15 trabajadores de la salud han sido infectados en Wuhan. La fuente original del brote sigue siendo desconocida y, por lo tanto, se esperan más casos y muertes en Wuhan y en China. Es posible que también se detecten más casos entre viajeros de Wuhan a otros países.
Existen considerables incertidumbres en la evaluación del riesgo de este evento, debido a la falta de análisis epidemiológicos detallados.
Sobre la base de la información actualmente disponible, el ECDC considera que:

• el impacto potencial de los brotes de 2019-nCoV es alto;
• es probable una mayor propagación mundial;
• actualmente existe una probabilidad moderada de infección para los viajeros de la UE / EEE que visitan Wuhan;
• existe una alta probabilidad de importación de casos en países con el mayor volumen de personas que viajan hacia y desde Wuhan (es decir, países de Asia);
• existe una probabilidad moderada de detectar casos importados a países de la UE / EEE;
• El cumplimiento de las prácticas apropiadas de prevención y control de infecciones, particularmente en entornos de atención médica en países de la UE / EEE con vínculos directos con Wuhan, significa que la probabilidad de que un caso reportado en la UE resulte en casos secundarios dentro de la UE / EEE es baja.

REFERENCIA:
ECDC: Risk assessment: Outbreak of acute respiratory syndrome associated with a novel coronavirus, Wuhan, China; first update

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Guía provisional para evitar la propagación de 2019-nCoV #Coronavirus

Esta guía provisional se basa en lo que se sabe actualmente sobre el nuevo coronavirus 2019 (2019-nCoV) y la transmisión de otras infecciones respiratorias virales. Los CDC actualizarán esta guía provisional según sea necesario y a medida que se disponga de información adicional. Los coronavirus son una gran familia de virus, algunos que causan enfermedades en las personas y otros que circulan entre los animales, incluidos los camellos, los gatos y los murciélagos. En raras ocasiones, los coronavirus animales pueden evolucionar e infectar a las personas y luego propagarse entre las personas, como se ha visto con MERS y SARS. Se desconoce el potencial de transmisión de persona a persona de 2019-nCoV. La siguiente guía provisional puede ayudar a evitar que este virus se propague entre las personas en los hogares y en las comunidades.
REFERENCE:
Interim Guidance for Preventing 2019 Novel Coronavirus (2019-nCoV) from Spreading to Others in Homes and Communities

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Isopropanol at 60% and at 70% are effective against 'isopropanol-tolerant' Enterococcus faecium

The bactericidal activity of isopropanol was determined against Enterococcus faecium ATCC 6057, ST 796 (isopropanol-tolerant strain) and Enterococcus hirae ATCC 10541 (EN 13727). Isopropanol at 60% and 70% were effective (≥5.38 log10-reduction) in 15 s against all strains but 23% isopropanol was not (<0.99 log10-reduction in ≤15 min). Isopropanol at 70% was tested against E. faecium in the four-field test. Eight millilitres was not effective enough in 1 min (<5 log10-reduction), whilst 16 mL was effective (≥5.85 log10-reduction). Healthcare workers can be reassured that 60% and 70% isopropanol with an appropriate volume are effective against E. faecium.
REFERENCE:
Gebel J, et al. Isopropanol at 60% and at 70% are effective against 'isopropanol-tolerant' Enterococcus faecium. J Hosp Infect. 2019 Sep;103(1):e88-e91. doi: 10.1016/j.jhin.2019.01.024. Epub 2019  Feb 1. PubMed PMID: 30711531.

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Reglamentación para transporte de sustancias infecciosas 2019–2020

El trabajo con agentes biológicos desempeña un papel clave en la detección y prevención de brotes de enfermedades emergentes y altamente infecciosas, así como en la reducción de otros riesgos para la seguridad sanitaria internacional. Este trabajo incluye actividades de diagnóstico, investigación biomédica y fabricación de productos farmacéuticos. Las instalaciones que manipulan agentes biológicos tienen la responsabilidad de garantizar que los agentes biológicos sean identificados, almacenados y se controlen de forma segura en instalaciones adecuadamente equipadas, de acuerdo con las buenas prácticas. Mientras se transportan materiales que contengan agentes biológicos, existe la posibilidad de exposición para las personas y el medio ambiente por el que pasa el material. Para controlar y reducir adecuadamente este riesgo, varios grupos internacionales han desarrollado recomendaciones o reglamentaciones (o ambas) que describen la forma en que las sustancias infecciosas deben ser envasadas, marcadas, etiquetadas y documentadas, para garantizar la seguridad y su contención durante todo el proceso de transporte.
REFERENCIAS:
WHO/WHE/CPI/2019.20  © Organización Mundial de la Salud 2019. Guía sobre la reglamentación relativa al transporte de sustancias infecciosas 2019–2020

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#Historia: EL INFORME BELMONT: Principios éticos y directrices para la protección de los sujetos humanos de investigación

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18 de abril de 1979
AGENCIA: Departamento de Salud, Educación y Bienestar, Estados Unidos.
ACCIÓN: Notificación de informe para comentario público.
RESUMEN: El 12 de julio de 1974, se promulgó la Ley Nacional de Investigación (Pub. L. 93-348), creando la Comisión Nacional para la Protección de Sujetos Humanos de la Investigación Biomédica y del Comportamiento. Una de las acusaciones a la Comisión fue identificar los principios éticos básicos que deberían ser la base de la investigación biomédica y conductual en seres humanos y desarrollar pautas que deberían seguirse para garantizar que dicha investigación se realice de acuerdo con esos principios. Al llevar a cabo lo anterior, se indicó a la Comisión que considerara: (i) los límites entre la investigación biomédica y conductual y la práctica aceptada y rutinaria de la medicina, (ii) el papel de la evaluación de los criterios de riesgo-beneficio en la determinación de la idoneidad de investigación que involucra sujetos humanos, (iii) pautas apropiadas para la selección de sujetos humanos para participar en dicha investigación y (iv) la naturaleza y definición del consentimiento informado en diversos entornos de investigación.
El Informe Belmont intenta resumir los principios éticos básicos identificados por la Comisión en el curso de sus deliberaciones. Es el resultado de un intenso período de cuatro días de discusiones que se llevaron a cabo en febrero de 1976 en el Centro de Conferencias Belmont de la Institución Smithsonian, complementado por las deliberaciones mensuales de la Comisión que se llevaron a cabo durante un período de casi cuatro años. Es una declaración de principios y pautas éticas básicas que deberían ayudar a resolver los problemas éticos que rodean la realización de investigaciones con seres humanos. Al publicar el Informe en el Registro Federal y proporcionar reimpresiones a solicitud, el Secretario tiene la intención de que esté disponible para los científicos, los miembros de las Juntas de Revisión Institucional y los empleados federales. El Apéndice de dos volúmenes, que contiene los extensos informes de expertos y especialistas que ayudaron a la Comisión a cumplir con esta parte de su cargo, está disponible como Publicación DHEW No. (OS) 78-0013 y No. (OS) 78-0014, para venta por el Superintendente de Documentos, Imprenta del Gobierno de los Estados Unidos, Washington, DC 20402.
A diferencia de la mayoría de los otros informes de la Comisión, el Informe Belmont no hace recomendaciones específicas para la acción administrativa del Secretario de Salud, Educación y Bienestar. Más bien, la Comisión recomendó que el Informe Belmont se adopte en su totalidad, como una declaración de la política del Departamento. El Departamento solicita comentarios públicos sobre esta recomendación.
REFERENCIA:
THE BELMONT REPORT: Ethical principles and guidelines for the protection of human subjects of research

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Tétanos en un niño no vacunado - Oregon, 2017

Título original: Opisthotonus
Autor: Charles Bell
Año: 1809
Localización: Royal College of Surgeons (Edinburgo)

El tétanos es una enfermedad neuromuscular aguda causada por la bacteria Clostridium tetani. Las esporas bacterianas que se encuentran en el suelo pueden ingresar al cuerpo a través de la alteración de la piel, con un inicio posterior de enfermedad clínica que varía de 3 a 21 días (generalmente dentro de 8 días). En 2017, un niño de 6 años que no recibió ninguna vacuna sufrió una laceración en la frente mientras jugaba al aire libre en una granja; la herida fue limpiada y suturada en casa. Seis días después, tuvo episodios de llanto, apretamiento de la mandíbula y espasmos musculares involuntarios de las extremidades superiores, seguidos de arcos en el cuello y la espalda (opistótonos) y espasticidad generalizada. Más tarde ese día, al comienzo de la dificultad para respirar, los padres se comunicaron con los servicios médicos de emergencia, quienes lo transportaron por aire directamente a un centro médico pediátrico terciario. Posteriormente, el niño recibió un diagnóstico de tétanos y requirió aproximadamente 8 semanas de atención hospitalaria, seguido de atención de rehabilitación, antes de que pudiera reanudar sus actividades normales.

REFERENCIA:

Guzman-Cottrill JA, Lancioni C, Eriksson C, Cho Y, Liko J. Notes from the Field: Tetanus in an Unvaccinated Child — Oregon, 2017. MMWR Morb Mortal Wkly Rep 2019;68:231–232. DOI: http://dx.doi.org/10.15585/mmwr.mm6809a3

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Biobanks for life sciences and personalized medicine

Importance of standardization, biosafety, biosecurity, and data management.
Biological samples such as tissues, blood and other body fluids, plants or seeds, prokaryotic and eukaryotic cells or isolated biomolecules as well as associated data are the essential raw material for research and development in medicine, biotechnology and agriculture. The collection, processing, preservation, and storage of these resources, in addition to provision of access, are key activities of biobanks or biological resource centres. Biobanks have to ensure proper quality of samples and data, ethical and legal compliance as well as transparent and efficient access procedures. In this context the review places special emphasis on pre-analytical procedures and international standards, which are essential to improving analytical data reliability and reproducibility, as well as on the increasing importance of data management. These requirements of biobanks are demonstrated using the example of pathogen-containing and microbiome biobanks, and refer to needs in cancer research and development.
REFERENCE:
Müller H, Dagher G, Loibner M, Stumptner C, Kungl P, Zatloukal K. Biobanks for life sciences and personalized medicine: importance of standardization, biosafety, biosecurity, and data management. Curr Opin Biotechnol. 2019 Dec 30;65:45-51. doi: 10.1016/j.copbio.2019.12.004. [

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Una revisión y crítica de la investigación académica de seguridad de laboratorio

En los últimos diez años, ha habido varios accidentes de alto perfil en laboratorios académicos de todo el mundo, que han resultado en lesiones y muertes significativas. Las secuelas de estos incidentes a menudo se caracterizan por llamados a la reflexión y al reexamen del enfoque de la disciplina académica para la investigación y la política de seguridad. Sin embargo, el estudio de la seguridad académica en el laboratorio aún está poco desarrollado y no se han recopilado los datos necesarios sobre los cambios en las actitudes y comportamientos de seguridad. Este artículo de revisión examina críticamente el estado de la investigación académica sobre seguridad química desde una posición multifactorial, incluida la investigación sobre la ocurrencia de accidentes de laboratorio, los contribuyentes a los accidentes de laboratorio, el estado de la investigación de capacitación en seguridad y las barreras culturales para realizar investigaciones de seguridad e implementar prácticas de laboratorio más seguras . La revisión concluye delineando preguntas de investigación que deben abordarse para minimizar futuros incidentes académicos de laboratorio, así como enfatizando la necesidad de un liderazgo comprometido de nuestras instituciones de investigación.

REFERENCE:

Ménard AD, Trant JF. A review and critique of academic lab safety research. Nat Chem. 2020 Jan;12(1):17-25. doi: 10.1038/s41557-019-0375-x. Epub 2019 Nov 18. Review. PubMed PMID: 31740762.

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Un ensayo clínico aleatorizado para evaluar la seguridad, el ajuste y la comodidad de una nueva máscara N95 en niños

Los niños son más vulnerables a los riesgos de contaminación del aire, incluida la susceptibilidad a contraer enfermedades crónicas en los pulmones en desarrollo. A pesar de esto, no hay máscaras específicas diseñadas y probadas en niños que estén disponibles para proteger a nuestros jóvenes de los contaminantes atmosféricos comunes en la actualidad. Evaluamos la seguridad, el ajuste y la comodidad de una máscara N95 pediátrica especialmente diseñada con un micro ventilador opcional (micro ventilador, MF) en niños sanos de 7 a 14 años de edad, en un diseño cruzado aleatorio de dos períodos. Las medidas fisiológicas cardiorrespiratorias de los sujetos se evaluaron en diferentes estados de actividad física bajo diferentes intervenciones (máscara sin y con MF). Se reclutó un total de 106 sujetos entre julio y agosto de 2016. El uso de la máscara sin MF aumentó el CO2 al final de la marea (ETCO2) y la concentración fraccional de CO2 inspirado (FICO2) en reposo y con un esfuerzo leve, como se esperaba. El uso de la máscara con MF acercó los niveles de FICO2 comparativamente a los niveles de referencia sin la máscara para ambas actividades. Se descubrió que la máscara, con o sin MF, se ajustaba bien, era cómoda y segura para su uso en niños en reposo y con esfuerzo leve. La máscara N95 probada ofrece un comienzo prometedor para más estudios en la población pediátrica.
REFERENCIA:
Goh, Daniel Yam Thiam et al. A randomised clinical trial to evaluate the safety, fit, comfort of a novel N95 mask in children. Scientific reports vol. 9,1 18952. 12 Dec. 2019, doi:10.1038/s41598-019-55451-w

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Guidelines for Biosafety in Teaching Laboratories Version 2.0: A Revised and Updated Manual for 2019

The original Guidelines for Biosafety in Teaching Laboratories were developed in 2012 in response to an outbreak of Salmonella Typhimurium tracked by the Centers for Disease Control and Prevention (CDC) that originated from clinical and teaching microbiology laboratories. In the 7 years since the publication of the guidelines, there have been two subsequent CDC-reported Salmonella outbreaks originating from clinical and teaching microbiology laboratories. Use of and issues with the guidelines by ASM members have been tracked by various means since publication, and in 2018 it became apparent that an update of the guidelines was necessary. The Education Board of the American Society for Microbiology charged this task force with updating the guidelines based on the accumulated information. While the guidelines should look familiar, users will find that the originally separate BSL1 and BSL2 guidelines have been rolled into one document, to help eliminate redundancy and confusion. In addition, sections on risk assessment and service animals in the teaching laboratory have been added. These updated guidelines should help clarify many of the issues for which users expressed problems with the original guidelines.
REFERENCE:
Byrd, Jeffrey J et al. Guidelines for Biosafety in Teaching Laboratories Version 2.0: A Revised and Updated Manual for 2019. Journal of microbiology & biology education vol. 20,3 20.3.57. 18 Dec. 2019, doi:10.1128/jmbe.v20i3.1975

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Feliz Año 2020

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Sistema de implementación de un sistema de biovigilancia en la República de Corea y sus ramificaciones legales

Las leyes son herramientas fundamentales que regulan y gestionan diversos temas para proteger los derechos de las personas en una sociedad. La legislación sobre vigilancia de enfermedades permite a las agencias regular y gestionar la salud pública, incluida la prevención de la propagación de enfermedades infecciosas. Evaluamos la Ley de Prevención y Control de Enfermedades Infecciosas de Corea (IDPCA) a través de la lente de la biovigilancia para comprender su efectividad en la protección de la salud pública. Además, se examinaron la legislación y los reglamentos pertinentes de los Estados Unidos y la Organización Mundial de la Salud. La evaluación concluye que el IDPCA actual es limitado en términos de proporcionar orientación para la detección temprana y la respuesta a los peligros utilizando datos integrados y un sistema de intercambio de información. Se necesita una mayor revisión de las leyes para permitir la detección temprana y la advertencia de posibles amenazas a la salud pública.
REFERENCIA:
Kim AJ, Tak S. Implementation System of a Biosurveillance System in the Republic of Korea and Its Legal Ramifications [published online ahead of print, 2019 Dec 3]. Health Secur. 2019;10.1089/hs.2019.0071. doi:10.1089/hs.2019.0071

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#Orientia: Recomendaciones para la biocontención basada en el riesgo, las prácticas laborales y el caso de reclasificación al grupo de riesgo 2

El tifus de matorral es una importante enfermedad transmitida por artrópodos que causa una enfermedad febril aguda significativa por infección con Orientia spp. Usando un enfoque basado en el riesgo, esta revisión examina la práctica actual, la base de evidencia y los requisitos reglamentarios con respecto a cuestiones de bioseguridad y bioseguridad, y presenta el caso para la reclasificación del Grupo de riesgo 3 al Grupo de riesgo 2 junto con recomendaciones para prácticas de trabajo seguras de actividades basadas en el riesgo durante la manipulación de Orientia spp. en el laboratorio. Recomendamos reclasificar Orientia spp. al Grupo de riesgo 2 basado en la clasificación de los patógenos RG2 como riesgo individual moderado, riesgo comunitario bajo. Recomendamos que las actividades de bajo riesgo se puedan realizar dentro de un gabinete de seguridad biológica ubicado en un laboratorio central de Nivel de Bioseguridad (BSL) 2 utilizando equipo de protección personal estándar. Pero cuando la evaluación de riesgos indica, como una alta concentración y volumen, o la generación de aerosoles, entonces se justifica un mayor nivel de biocontención. Para la mayoría de las actividades animales que involucran a Orientia spp., Se recomienda Animal BSL 2 (ABSL2), sin embargo, cuando se realizan actividades de alto riesgo, incluidas las necropsias, se recomienda Animal BSL (ABSL3).

REFERENCIA:

Blacksell SD, Robinson MT, Newton PN, et al. Biosafety and biosecurity requirements for Orientia spp. diagnosis and research: recommendations for risk-based biocontainment, work practices and the case for reclassification to risk group 2. BMC Infect Dis. 2019;19(1):1044. Published 2019 Dec 10. doi:10.1186/s12879-019-4653-4

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Removal efficiency of central vacuum system and protective masks to suspended particles from dental treatment

Background.  High levels of suspended particulate matters (PMs) and bioaerosols are created by dental procedures. The present study aimed to evaluate the size and concentration of PMs produced by drilling and grinding teeth, and to assess the efficiency of central vacuum system and protective masks for the removal of PMs.
Methods. A total of 20 extracted permanent teeth were collected. A novel experimental system and particle counter were used to evaluate the PMs produced by dental procedures and the PM removal efficiency of a central vacuum system and surgical/N95 masks.
Results. The number concentration of total PMs produced by drilling and grinding teeth was significantly higher than the indoor background concentration. The average aerodynamic diameter of particle was generally less than 1 μm. The average number concentration of ultrafine particles was 2.1x1011 particles/m3 during tooth drilling and grinding. The efficiency of the central vacuum system was 35.74% for PM≥0.5 and 35.41% for PM10. For PM≥0.5, the ratios of inside and outside masks were 0.8–1.34 without vacuum and 1.18–1.36 with vacuum. No difference was found with the use of surgical/N95 masks during dental therapy, with or without vacuum use.
Conclusions. High levels of PMs were found during tooth drilling and grinding procedures, especially among PM1. The PM removal efficiency of a central vacuum system and surgical/N95 masks were limited.
REFERENCE:
Liu MH, et al. Removal efficiency of central vacuum system and protective masks to suspended particles from dental treatment. PLoS One. 2019;14(11):e0225644. Published 2019 Nov 26. doi:10.1371/journal.pone.0225644

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Felices fiestas!

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Métodos efectivos para la inactivación de Francisella tularensis

Francisella tularensis (F. tularensis) es altamente patógena para los humanos y debe manejarse en condiciones de bioseguridad de nivel 3. Las muestras utilizadas para el diagnóstico y el análisis experimental deben estar completamente inactivadas, aunque los métodos para la inactivación de F. tularensis son limitados. En este estudio, los métodos efectivos para la inactivación de F. tularensis SCHU P9 y otras cinco cepas se determinaron mediante comparaciones de unidades formadoras de colonias entre las muestras tratadas y las de control. Los resultados mostraron que F. tularensis SCHU P9 se desnaturalizó mediante tratamiento térmico (94 ° C durante 3 min y 56 ° C durante 30 min), filtración con un filtro de 0.22 μm y el uso de varias soluciones (es decir,> 70% de etanol, metanol, acetona y paraformaldehído al 4%). F. tularensis SCHU P9 permaneció viable después del tratamiento con etanol al 50% durante 1 minuto, filtración con un filtro de 0,45 μm y tratamientos con detergentes (es decir, tampón de dodecil sulfato de litio al 1%, Triton X-100 al 1% y Nonidet P-40 al 1% ) a 4 ° C durante 24 h. Además, F. tularensis SCHU P9 suspendido en suero bovino fetal en tubos de plástico fue altamente resistente a la radiación ultravioleta en comparación con las suspensiones en agua y medio químicamente definido. Los métodos para la inactivación de F. tularensis SCHU P9 se aplicaron a las otras cinco cepas de F. tularensis. Los datos presentados en este estudio podrían ser útiles para el establecimiento de pautas y procedimientos operativos estándar (SOP) para inactivar las muestras contaminadas no solo en F. tularensis sino también en otras bacterias.

REFERENCIAS:

1. Azaki, Mika et al. Effective methods for the inactivation of Francisella tularensis. PloS one vol. 14,11 e0225177. 14 Nov. 2019, doi:10.1371/journal.pone.0225177
2. Pathogen Safety Data Sheet, Francisella tularensis. Health Canada.

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Transmisión nosocomial de virus emergentes a través de procedimientos médicos generadores de aerosol

Los recientes eventos de transmisión nosocomial de virus emergentes y reemergentes, incluidos el virus del Ébola, el coronavirus del síndrome respiratorio de Oriente Medio, el virus Nipah y el orthonairovirus de la fiebre hemorrágica de Crimea-Congo, han puesto de manifiesto el riesgo de transmisión nosocomial de virus emergentes en entornos de atención médica. En particular, las preocupaciones y precauciones han aumentado con respecto al uso de procedimientos médicos generadores de aerosol cuando se trata a pacientes con tales infecciones virales. A pesar de las crecientes asociaciones entre los procedimientos médicos generadores de aerosoles y la transmisión nosocomial de virus, todavía tenemos una comprensión deficiente de los riesgos de procedimientos y virus específicos.

Tipos potenciales de procedimientos médicos que generan aerosoles
(AGMP). Los AGMP se pueden dividir en procedimientos que
inducen al paciente  a producir aerosoles y procedimientos que
generan aerosoles mecánicamente.

Para identificar qué procedimientos médicos generadores de aerosoles y virus emergentes presentan un alto riesgo para los trabajadores de la salud, exploramos los mecanismos de los procedimientos médicos generadores de aerosoles, así como las vías de transmisión y las características de los virus altamente patógenos asociados con la transmisión nosocomial. . Luego, proponemos cómo la investigación, tanto en entornos clínicos como experimentales, podría avanzar en las pautas actuales de control de infecciones.
REFERENCIA:
Judson, Seth D, and Vincent J Munster. Nosocomial Transmission of Emerging Viruses via Aerosol-Generating Medical Procedures. Viruses vol. 11,10 940. 12 Oct. 2019, doi:10.3390/v11100940

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Assessment of Health Facilities for Airborne Infection Control Practices and Adherence

Introduction: Nosocomial transmission of airborne infections, such as H1N1, drug-resistant tuberculosis, and Nipah virus disease, has been reported recently and has been linked to the limited airborne infection control strategies. The objective of the current study was to assess the health facilities for airborne infection control (AIC) practices and adherence to the National AIC (NAIC) guidelines, 2010.
Materials and Methods: A cross-sectional study was conducted in 25 public and 25 private hospitals selected from five randomly selected districts in the state of Kerala. A checklist with 62 components was developed based on the NAIC guidelines. Frequencies, percentages, and mean with standard deviation were used to summarize facility risk assessment and compliance to guidelines.
Results: Most of the facilities had infection control committees 35 (70%). Annual infection control trainings were held for staff in 21 (42%) facilities. Twenty (40%) facilities were not familiar with NAIC guidelines. Counseling on cough etiquette at registration was practiced in 5 (10%) institutions. Cross ventilation was present in outpatient departments in 27 (54%) institutions. Sputum was disposed properly in 43 (86%) institutions. N95 masks were available in high-risk settings in 7 (14%) health facilities.
Conclusion: There exist deficiencies in adherence to all components of NAIC guidelines including administrative, environmental, and use of personal protective equipment in both government and private hospitals in the state.
REFERENCE:
Raj A, et al. Assessment of Health Facilities for Airborne Infection Control Practices and Adherence to National Airborne Infection Control Guidelines: A Study from Kerala, Southern India. Indian J Community Med. 2019;44(Suppl 1):S23–S26. doi:10.4103/ijcm.IJCM_25_19


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The pandemic influenza threat

Aims: This paper aims to summarise the growing literature concerning an imminent future influenza pandemic, from the primary care perspective.

Methods: Sources of literature were scanned and relevant material short-listed for further study from: (1) WHO and CDC websites; (2) PUBMED; and (3) papers mentioned in references of full-text papers.
Results: Outbreaks of avian influenza in Asia and elsewhere indicate that the world may be moving towards a pandemic influenza outbreak. The WHO Global Influenza Preparedness Plan 2005 unifies the world with the vision of tackling the next pandemic influenza outbreak as a global effort that includes healthcare provider and patient alike.
Conclusions: We need to update ourselves and keep our staff and patients informed to make infection control measures part of our daily activities. In areas where there are contacts with animal reservoirs of influenza A, patients need to be reminded that they need to protect themselves from being infected.
REFERENCIA:
Goh, Lee Gan, and Pak Yean Cheong. The pandemic influenza threat: a review from the primary care perspective. Primary care respiratory journal : journal of the General Practice Airways Group vol. 15,4 (2006): 222-7. doi:10.1016/j.pcrj.2006.04.193

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Procedimiento NIOSH para determinar la eficiencia de filtración N95

Este procedimiento establece los medios para asegurar que la eficiencia de filtración particulada de filtros N95 usados en respiradores sin energía enviados para aprobación, extensión de la aprobación o examinados durante las auditorias de productos certificados, reúne los estándares mínimos establecidos en la 42CFR, parte 84, subparte K, $84.181. Estos filtros o filtros de cartuchos pueden estar integrados a la construcción del respirador; montados individualmente, o en grupos de hasta tres; usados en conjunto con cartuchos o canastas para máscaras de gas estilo barbilla, montados al frente, y montados atrás; o usados en combinación con respiradores de gas-vapor o con abastecimiento de atmósfera.
REFERENCIA:
Procedure No, TEB-APR-STP-0059. Determination of particulate filter efficiency level for N95 series filters against solid particulates for non-powered, air purifying respirators standard tresting procedure (STP). NIOSH 2019Oct31.


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Risk of transmission via medical employees of MERS

Background: In 2015, South Korea experienced an outbreak of Middle East respiratory syndrome (MERS), and our hospital experienced a nosocomial MERS infection. We performed a comprehensive analysis to identify the MERS transmission route and the ability of our routine infection-prevention policy to control this outbreak.
Methods: This is a case–cohort study of retrospectively analysed data from medical charts, closed-circuit television, personal interviews and a national database. We analysed data of people at risk of MERS transmission including 228 in the emergency department (ED) and 218 in general wards (GW). Data of personnel location and movement, personal protection equipment and hand hygiene was recorded. Transmission risk was determined as the extent of exposure to the index patient: 1) high risk: staying within 2 m; 2) intermediate risk: staying in the same room at same time; and 3) low risk: only staying in the same department without contact.
Results: The index patient was an old patient admitted to our hospital. 11 transmissions from the index patient were identified; 4 were infected in our hospital. Personnel in the ED exhibited higher rates of compliance with routine infection-prevention methods as observed objectively: 93% wore a surgical mask and 95.6% washed their hands. Only 1.8% of personnel were observed to wear a surgical mask in the GW. ED had a higher percentage of high-risk individuals compared with the GW (14.5% vs. 2.8%), but the attack rate was higher in the GW (16.7%; l/6) than in the ED (3%; 1/33). There were no transmissions in the intermediate- and low-risk groups in the ED. Otherwise 2 patients were infected in the GW among the low-risk group. MERS were transmitted to them indirectly by staff who cared for the index patient.
Conclusions:  Our study provide compelling evidence that routine infection-prevention policies can greatly reduce nosocomial transmission of MERS. Conventional isolation is established mainly from contact tracing of patients during a MERS outbreak. But it should be extended to all people treated by any medical employee who has contact with MERS patients.
Trial registration: NCT02605109, date of registration: 11th November 2015.
REFERENCE:
Ki, Hyun Kyun et al. Risk of transmission via medical employees and importance of routine infection-prevention policy in a nosocomial outbreak of Middle East respiratory syndrome (MERS): a descriptive analysis from a tertiary care hospital in South Korea. BMC pulmonary medicine vol. 19,1 190. 30 Oct. 2019, doi:10.1186/s12890-019-0940-5

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Potential of Cell-Free Protein Synthesis

Cell-free protein synthesis (CFPS) system is a simple, rapid, and sensitive tool that is devoid of membrane-bound barriers, yet contains all the mandatory substrates, biomolecules, and machineries required for the synthesis of the desired proteins. It has the potential to overcome loopholes in the current in vivo production systems and is a promising tool in both basic and applied scientific research. It facilitates a simplified organization of desired experiments with a variety of reaction conditions, making CFPS a powerful tool in biological research. It has been used for the expansion of genetic code, assembly of viruses, and in metabolic engineering for production of toxic and complex proteins. Subsequently, CFPS systems have emerged as potent technology for high-throughput production of membrane proteins, enzymes, and therapeutics. The present review highlights the recent advances and uses of CFPS systems in biomedical, therapeutic, and biotechnological applications. Additionally, we highlight possible solutions to the potential biosafety issues that may be encountered while using CFPS technology.
REFERENCE:
Khambhati K, et al. Exploring the Potential of Cell-Free Protein Synthesis for Extending the Abilities of Biological Systems. Front Bioeng Biotechnol. 2019 Oct 11;7:248. doi: 10.3389/fbioe.2019.00248. eCollection 2019. Review. PubMed PMID: 31681738; PubMed Central PMCID: PMC6797904.

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